作为全省农业和林业专门研究机构，bat365官方网站开展选育高产优质农作物和林木新品种、农林业应用技术、生物技术、植物保护、土壤肥料、早作农业、野生植物开发利用、生态保护等方面的研究，服务我省农林业生产。自本院实施“十二五”规划以来，根据西部大开发和我省农林业生产的需求，我院紧紧围绕高原现代农业建设和特色产业需求，进一步整合分散资源，优化资源配置，积极调整学科结构。建成了作物学博士学位点1个，作物遗传育种和作物栽培与耕作学硕士学位点2个。基本形成了面向高原现代农业，区域特色鲜明，学科类别丰富，以任务带学科的新型学科体系，逐步形成了我院的优势学科和重点发展学科、重点培育学科。今后将继续加强春油菜、马铃薯、麦类、豆类、玉米、蔬菜、林木等七大类农林作物遗传育种优势学科建设；继续优化植物保护、农业资源环境为主的传统基础学科建设；积极培育农产品加工、水肥一体化、农产品质量安全控制、枸杞育种栽培、农林业生态保护等新兴学科建设；不断提升分子遗传育种技术研发与应用等技术手段。
优势学科
1、农作物遗传育种：农作物遗传育种学科开展了青海省春油菜育种、春小麦育种、青稞育种、蚕（碗）豆育种、玉米育种及马铃薯育种等六大农作物和蔬菜育种与栽培技术等七个方向的遗传育种研究。
春油菜育种：是我省重点优势学科，近十年陆续培育出了油菜杂交种十多个、油白菜杂交种3个。青杂1号、青杂2号、青杂3号和青杂5号先后是青海、甘肃、新疆和内蒙等春油菜区的主栽品种和国家春油菜区域试验的对照品种。我院油菜所培育的春油菜品种青杂7号再次被农业部遴选为2016年全国油菜主导品种。该品种已连续四年被农业部遴选为全国油菜主导品种，也是整个春油菜区（青海、甘肃、新疆、内蒙等省区）唯一入选的油菜品种。
春小麦育种：采取常规杂交育种，应用太谷核不育基因、远源杂交、外源DNA导入和加代等技术，共育成小麦品种12个，其中“青春38”质量达到了“国家中筋小麦标准”，是集欧洲、南美育种质量标准为标准培育出来的小麦新品种，已成为本省农民最喜爱的春小麦品种。
青稞育种：主要是采取常规杂交育种，先后培育出了青莜1号、2号、昆仑10号、昆仑164，昆仑12号、昆仑13号、昆仑14号、昆仑15号等新品种。目前青稞育种目标重点趋向于早熟、优质、丰产和多抗等方面的研究，重点突出高蛋白质、脂肪、纤维、淀粉和β-葡聚糖等品质方面的新品种选育。
豆类（蚕豆、豌豆）：是我省的优势农作物和传统的出口农产品，在保持其“名、特、优”的基础上开展遗传育种研究，主要包括品种资源遗传研究、专用品种选育及其配套高效栽培技术研究等，共培育蚕豌豆品种12个。
马铃薯育种：我省马铃薯育种趋向于专用化、特色化。近年来，根据我省的气候优势，培育了一系列马铃薯新品种，包括青薯系列2-10号，青薯168，高原系列1-8号，其中青薯2号为高淀粉品种（25.83%）， 2004年获国家科技进步二等奖；青薯9号为高抗旱品种，08年创青海旱地马铃薯最高产（4548.4kg）。
玉米育种：进行玉米的选育和示范推广，2015年12月28日，我院作物所引进的青贮玉米品种“纪元8号”通过青海省第八届农作物品种审定委员会第五次会议审定。该品种是我院通过审定的第一个玉米品种，也是青海省通过审定的第一个青贮玉米品种。
蔬菜新品种选育：通过蔬菜新品种选育，发展无公害蔬菜，制定技术规范等，促进我省农业结构调整，并育成了线辣椒品种“青线椒1、2号”、2号甜椒、青椒3、4号，杂交甘蓝品种“青甘1号”，菊芋新品种“青芋1、2、3、4号”等，高原油白菜1、3、4号等。
2、生物技术：在植物组织培养、马铃薯脱毒、病毒检测方面做了大量研究，建立并完善了马铃薯脱毒体系，为青海马铃薯脱毒种薯产业发展奠定了坚实的基础，使我省在马铃薯种质资源研究及脱毒种薯生产技术达到国内领先水平。
重点发展学科
1、土壤肥料方向：在土壤肥料研究方面开展了包括土地资源环境监测、肥料施用技术、农业微生物利用、测土配方施肥以及专用肥的开发等。针对不同地区、不同土壤类型、不同作物开发的专用复混肥，应用较广的有油菜、小麦、马铃薯、蔬菜等专用肥。
2、野生植物资源开发方向：针对青海高原的特色野生植物资源，开展了荨麻、罗布麻等野生植物有效成分提取和功能成分分离以及食用菌资源的开发，目前，食用菌的研究已初具规模。
3、植物保护方向：立足青海实际，紧密结合省情，主要在植物病害、农业昆虫、农田杂草防除及病虫草综合防治方面开展了大量研究，在农田杂草、辣椒疫病、小麦条锈病等方面取得了显著成绩，并研制开发了一系列生物农药及除草剂等。
4、林木育种及生态保护研究方向：立足于青海高原生态治理和经济建设需要,以开展林木育种、森林培育、生态环境保护、森林经营、荒漠化治理、森林资源开发利用、城市绿化为主要研究方向，取得了一系列研究成果，为青海地区的生态建设和经济发展作出了突出贡献。先后选育出了林木新品种3个，枸杞新品种2个。
重点培育学科
依靠青海农林科学院的科研实力，加强与农产品生产与加工企业合作，实现农产品加工原料的区域化、标准化，农产品深加工产品的规模化、品牌化、安全化生产。以春小麦、青稞、油菜、马铃薯、蚕碗豆等优势农产品资源为主要研究对象，开展精深产品加工技术、品质评价、综合利用、特效成分提取等方面的研究。创建一个以开发高附加值产品为目标，以农产品精深加工过程为技术载体的理论研究与技术开发平台。从而促进我省的食品科学研究水平提高，促进我省农产品、食品加工业的发展和水平提升。
