农林科学院始建于1951年5月，2000年11月,整建制划归青海大学，实行青海大学领导下的二级研究院管理体制；2018年2月,确定为公益一类事业单位，现已成为学科比较齐全、专业人才相对集中、条件设施基本完善的省级农林业综合科研机构。担负着青海高原农林业重大基础与应用基础研究、应用研究和示范推广的任务，致力于解决高原农林业及农村经济发展中基础性、方向性、全局性、关键性的重大科技问题，努力打造成为青海省农业科技服务创新基地和人才培养基地，支撑区域现代农业发展。

设有作物育种栽培（含旱地农业）、植物保护、园艺、土壤肥料、林业、春油菜、生物技术、野生植物资源8个专业研究所；拥有作物学博士后流动站，有一级博士学位授权点1个，二级学科硕士学位授权点3个。拥有国家农作物种质资源复份库、国家春油菜改良分中心、农业农村部青藏高原种质资源保护与遗传改良重点实验室（部省共建）、青海高原林木遗传育种国家林业局重点实验室等9个国家级科技创新平台，农业部基础性长期性科学观测站、农业部作物基因资源与种质创制青海科学观测实验站、农业部春油菜科学观测实验站等7个国家级科学观测实验站、高原特色农业示范基地（城北）和高山马铃薯基地（湟源）等2个国家现代农业科技示范展示基地、高原农作物种质资源科研科普基地等2个省级科普基地、4个农业部现代农业产业体系建设岗位、1个省实验室、7个省级重点实验室、6个省级农牧业科技创新平台、3个省级研究开发中心、4项服务资质。公开发行学术刊物《青海农林科技》。

现有在职职工178人，退休人员230人，各类专业技术人员158，博士以上人员占比达47%，高级职称以上人员占比达58%。目前有1个团队荣获第三届全国创新争先奖牌，并获青海省第四届“青海榜样”称号；6人享受国务院政府特殊津贴专家；1人入选国家“万人计划”青年拔尖人才；3人获批全国优秀科技工作者；1人荣获全国科普工作科技工作者；1人入选国家百千万人才工程有突出贡献中青年专家；1人荣获“第二届‘昆仑英才•青海学者’”称号；1人荣获青海省“最美科技工作者”荣誉称号；入选“帅才科学家”首批入库专家2人；4人入选青海省“135高层次人才培养工程”；34人获批青海省自然学科与工程技术学科带头人；入选“昆仑英才·高端创新创业人才”57人、创新创业团队4个、乡村振兴人才5人；并有青海省优秀专家4人、青海省优秀专业技术人才5人、中青年科技人才托举工程托举人选2名、青海省“人才小高地”团队2个、青海省科技兴农突出贡献团队2个。柔性引进“昆仑学者”2人，并有教学科研团队23个，国家农业产业体系岗位专家4人，青海省农业科技创新平台首席专家4人。

建院以来，累计取得科研成果920余项，获国家、省科技进步奖等各类奖励176项，其中国家科技进步二等奖2项、三等奖1项；中国政府友谊奖1项；青海省重大科技贡献奖2项、国际合作奖1项、科技进步一等奖8项、二等奖20项。经过多年的探索和积累，在春油菜、马铃薯、青稞、蚕豆等高原特色农作物育种和研究方面实现了突破，先后育成农作物品种157余个，支撑了青海省不同农作物品种4-6次的更新换代，保障了全省种植业结构的全面优化和战略调整；同时开展了马铃薯种薯脱毒、水肥一体化、农田病虫草害综合防控、林木遗传育种、寒旱区生态保护等技术研究和攻关，为我省高原现代特色农业和生态建设的发展提供了有效的科技支撑。（数据更新至2024年2月）